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发表于：2024/08/13 12:08:42
中新网深圳8月8日电 (记者 索有为)华大集团8日发布消息称，瑞典乌普萨拉大学近日联合华大集团旗下的华大生命科学研究院、华大基因智惠医学研究院，对逾千例结直肠癌样本进行了全基因组及转录组测序分析，发现了一系列与癌症不同阶段相关的基因，并识别了结直肠癌关键预后因子，为结直肠癌的预防、治疗及预后提供了数据基础，相关研究成果于8月7日发表于全球顶级学术期刊《自然》(Nature)，这也是目前全球最大的结直肠癌多组学研究。
据介绍，全球每年新增结直肠癌病例约190万，结直肠癌发病率居所有癌症第三位，约20%的患者在确诊时已发生转移，结直肠癌死亡率高居各类癌症第二位。
该研究基于华大智造DNBSEQ测序平台，对瑞典知名癌症样本与数据库U-CAN队列中的1063例结直肠癌样本进行全基因组和转录组测序分析，鉴定得到了96个显著突变基因，其中，有24个为新发现的潜在驱动基因，而与WNT, EGFR和TGF-β通路相关的驱动基因与结直肠癌生存显著相关。不仅如此，研究人员还利用突变时序分析，推导出了9个与癌症发生早期事件相关的驱动突变基因，和更倾向于在癌症发生的后期阶段出现的突变基因。这些发现为结直肠癌的早期检测和靶向治疗的开发提供了临床研究策略，并揭示了与肿瘤后期侵袭和转移相关的重要分子变化。
该研究中，研究人员通过全基因组和转录组测序分析发现在线粒体基因组和非编码区域中也存在与疾病相关的突变，并对与疾病进展显著相关的突变进行了系统性的总结，这些突破性的发现填补了非编码区在结直肠癌相关研究中的空白，将进一步推动对结直肠癌发病机制的理解。
随后，分析团队利用同一肿瘤样本的基因组和转录组数据进行了整合分析，验证了无论是否为微卫星不稳定肿瘤，其抑癌基因上的突变均导致基因表达降低，从而更容易患癌。进一步地，研究团队基于肿瘤基因表达差异，将结直肠癌预后分为了5个预后亚型CRPS，相较于结直肠癌经典的共识分子分型CMS，该研究构建的CRPS能更加准确地预测预后。
文章通讯作者、乌普萨拉大学的Tobias Sjöblom教授表示，该研究实现了迄今为止最大规模的结直肠癌基因组和转录组的综合分析，并将分子层面的发现与高质量的临床数据相结合，从而识别关键预后因子，这使这项研究有别于其他绝大多数癌症基因组学的研究。
文章共同通讯作者、华大基因智惠医学研究院林从博士表示，此次通过将华大先进的基因组学技术和数据分析资源应用于大规模结直肠癌人群，不仅发现多种突变事件对预后的显著预测效应，新构建的表达谱精细分型也将在未来指导结直肠癌个体化诊疗中发挥重要作用。期望未来能更加系统深入地解析不同肿瘤的发生发展机制，真正实现肿瘤的早诊早治。(完)